星期二, 11月 17, 2020

科學家的鳥基因 萬鳥基因體資料庫,達爾文也會興奮的好消息

這兩天有一個震動生物界的大消息,由丹麥,中國,美國等24個國家,125個研究機構,以及超過150位學者,累積了34年的田野調察和遠征,收集高品質的DNA樣品,嘔心瀝血建立的,萬鳥基因體資料庫(Bird 10,000 Genome Project, B10K),從世界各地的博物館,收集了大量鳥種的組織樣品,分析並建立的基因體資料,已經準備好提供大家使用了。 萬鳥基因體資料庫中含有363個種類的鳥基因體,資料其中267種都是第一次被解碼,涵蓋了世界上92%的鳥科(avian families)。並提供前所未有的大規模基因體資料分析。 鳥類成員們,不論是羽毛顏色,體型大小,飛行能力等,都有極大的差異,達爾文也曾為鳥類這些多彩多姿的變化而目眩神迷。然而為什麼會造成這樣的不同,秘密全都寫在基因體裡,建立這個鳥基因體資料庫正是解開這些演化謎團的開始。 這麼重要且目標宏大的鳥基因體資料庫的起始點,其是就是我們天天都能接觸的到的,雞。 科學家們深入研究雞蛋裡的小雞翅發育已經超久了,比對其他不會飛的平胸鳥類,如鴕鳥,鴯鶓之類,我們會發現鳥翅膀在解剖學上的演化。 過去我們知道,不會飛行的鳥類翅膀越來越短,飛行羽變得越來越沒用,然而腿卻越來越長,大姆趾也不見了,因為牠們不用站在樹枝上,開始在地上跑了。但是在這些型態變化上面,有許多模糊難辨的不同,在這樣的狀況下,科學家們各有各的說法,沒有其他更可靠的資訊和證據支持,就這樣,吵吵鬧鬧了好多年。 現在有了這個鳥基因體資料庫,科學家們可以尋線找出造成這些變化的密碼,了解在基因體上到底發生了什麼事。也可以整理出鳥類的演化樹,像家譜一樣追本溯源,找出鳥鳥們的老祖先,簡直就是科學家們的資訊金礦,說不定也可以平息一些科學家們的紛爭,科科。 萬鳥基因資料庫仍然會持續努力擴充資料,目標解碼超過2000種鳥基因體。 萬鳥基因體資料庫的鳥類組織樣品中,有40種是由世界上最老且最大的鳥類組織收集機構,美國路易斯安那大學自然科學博物館(LSU Museum of Natural Science,路科館)提供。路科館從1960年代開始收集動物標本,到現在共收藏了超過14萬個,約8千種脊椎動物標本。 還有40%的鳥類組織,來自位於美國華盛頓DC的,史密森尼國家自然歷史博物館(Smithsonian National Museum of Natural History)。其餘則來自哥本哈根大學的丹麥自然歷史博物館(Natural History Museum of Denmark)及其他機構。每一個都有豐富的館藏,真希望疫情快點過去,可以有機會去朝聖參觀~ 萬鳥基因體資料庫 https://b10k.genomics.cn/ 美國路易斯安那大學自然科學博物館 https://www.lsu.edu/mns/index.php 史密森尼國家自然歷史博物館 https://naturalhistory.si.edu/ 哥本哈根大學的丹麥自然歷史博物館 https://snm.ku.dk/english/ ------------------------------------------------------ 【 收聽 🎧 喜劇系科學 Podcast:Sky in the Wall】 Apple Podcast: 👉 https://reurl.cc/k0rn0n Anchor FM: 👉 https://anchor.fm/wallis-liu Youtube: 👉 https://reurl.cc/6l7KGr 【 收看 👀 喜劇系科學 Articles:Sky in the Wall】 Instagram: 👉 https://reurl.cc/m9rxMW Facebook: 👉 https://facebook.com/skyinthewall ------------------------------------------------------ 資料來源: https://www.bbc.com/news/science-environment-54904806 https://www.eurekalert.org/pub_releases/2020-11/fos--nbg111220.php https://cosmosmagazine.com/nature/birds/bird-genome-project-really-takes-off/ https://www.lsu.edu/mediacenter/news/2020/11/11biosci_faircloth_nature_b10k.php 圖片來源: https://www.nature.com/articles/s41586-020-2873-9 https://www.flickr.com/photos/skyinthewall/20161135466/ https://phys.org/news/2020-11-scientists-genomes-birds-avian-families.html #科學家的鳥基因 #生物資訊師們又有得忙了 #各種奇型怪狀的鳥都有阿 #好想去博物館



萬鳥基因體資料庫中含有363個種類的鳥基因體資料,其中267種都是第一次被解碼,一半以上都是雀鳥。這363個種類,涵蓋了世界上92%的鳥科(avian families)。


鳥家族中的成員們,不論是羽毛顏色,體型大小,飛行能力等,都有極大的差異,達爾文也曾為鳥類這些多彩多姿的變化而目眩神迷。


由丹麥,中國,美國等24個國家,125個研究機構,以及超過150位學者,累積了34年的田野調察和遠征,收集高品質的DNA樣品,嘔心瀝血建立的,萬鳥基因體資料庫(Bird 10,000 Genome Project, B10K),分析計算出的鳥鳥演化樹



雞,是基因體分析鳥類演化的最基礎模式動物


美國路易斯安那大學自然科學博物館(LSU Museum of Natural Science)共收藏了超過14萬個,約8千種脊椎動物標本。


一眼乍看還以為一堆青木瓜,原來是史密森尼國家自然歷史博物館抽屜裡的鳥類標本啊!




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