科學家的有機生命法則 Zoonomia Project

輸鳥不輸陣，說完鳥基因體，哺乳基因體也不干示弱。2006年開始，29 Mammal Project 當中，科學家就分析了，包括人類在內的29種哺乳動物基因體（約涵蓋49%的哺乳動物科）。2011年，這個計畫的發表結果，發現了人類基因體至少有 5.5% 還在不停進行負向澤汰（purifying selection），4.2% 則進入了演化約束（evolutionary constraint）。 上週在Nature發表的 Zoonomia Project ，原名 200 Mammal Project，打算要研究更多哺乳動物。後來改用傳說中，達爾文發展演化概念的源頭，達爾文阿公（Erasmus Darwin）關於人體病理，解剖和心理方面的著作，Zoonomia； or the Laws of Organic Life，為計畫取名。（可是達爾文本人並不承認有被阿公影響到阿....） Zoonomia Project 建立了131種哺乳類基因體資料，目標解碼每一個真獸下綱（Eutheria）中的144個科，每科至少一種動物，其中包括許多瀕危動物。加上先前已經建立的動物基因體資料，一共分析了240種哺乳類動物，涵蓋了80%的哺乳動物科，近1億1千萬年的演化過程。（相較於萬鳥基因體計畫，B10K，涵蓋92%的鳥科，共363種鳥類，稍稍遜色了一點）。 Zoonomia Project 為演化分析提供了寶貴的資源，科學家們發現，越是瀕危的動物，基因多樣性（genetic diversity）就越低。另外，科學家們也利用Zoonomia 資料庫來尋找動物們適應不同環境的基因機制，比如說比較人類基因，和身上穿著整套防水毛皮的水獺，還有一些會進入冬眠的老鼠們的基因，科學家們就可以多了解一點，關於人類代謝疾病的機制。科學家們比對人類和其他哺乳類動物的基因體，可以找到許多導致人類遺傳疾病的基因變異區域。 今年稍早，已經有科學家利用 zoonomia 來分析新冠病毒（SARS-CoV-2）可能影響的物種。新冠病毒的主要細胞受體（cellular receptor）是ACE2蛋白（angiotensin converting enzyme-2），而擁有ACE2蛋白的脊椎動物包括鳥，魚，兩棲，爬蟲和哺乳類，共410種。人類的ACE2上有25個胺基酸，對於新冠病毒的感染特別重要。依其他動物的ACE2上，這25個胺基酸與人類的相似度，科學家可以推估，這些動物受新冠病毒感染的危險性高低。科學家一共找到103種動物有可能感染新冠病毒，其中40%是瀕危動物....（天阿....希望不會有動物是因為新冠而滅亡的...）。 Zoonomia 哺乳動物基因體資料庫是線上公開資源，歡迎各界引用，分析，運用創意，發揮 zoonomia 最大的價值。 Zoonomia 哺乳動物基因體資料庫： https://zoonomiaproject.org/ ------------------------------------------------------ 【 收聽 🎧 喜劇系科學 Podcast：Sky in the Wall】 Apple Podcast: 👉 https://reurl.cc/k0rn0n Anchor FM: 👉 https://anchor.fm/wallis-liu Youtube: 👉 https://reurl.cc/6l7KGr 【 收看 👀 喜劇系科學 Articles：Sky in the Wall】 Instagram: 👉 https://reurl.cc/m9rxMW Facebook: 👉 https://facebook.com/skyinthewall ------------------------------------------------------ 資料來源： http://www.sci-news.com/genetics/131-placental-mammal-genomes-09049.html https://www.pnas.org/content/117/36/22311 https://www.technologynetworks.com/genomics/news/zoonomia-project-reveals-species-at-risk-of-extinction-342749 https://www.nature.com/articles/s41586-020-2876-6#Abs1 https://www.nature.com/articles/nature10530 圖片來源： http://faculty.baruch.cuny.edu/naturalscience/biology/darwin/biography/erasmus_darwin/zoonomia.html https://en.wikipedia.org/wiki/Erasmus_Darwin #科學家的有機生命法則 #達爾文阿公 #輸鳥不輸陣

zoonomia project 文青風的資料庫網頁（https://zoonomiaproject.org/）

達爾文阿公（Erasmus Darwin）關於人體病理，解剖和心理方面的著作，Zoonomia； or the Laws of Organic Life，正是哺乳動物基因體資料庫的名字由來

Zoonomia project 所分析的物種，約涵蓋80%的哺乳動物科

2011年發表的29 Mammal Project 所分析的物種，約涵蓋49%的哺乳動物科